หลังจากที่ใช้เวลาพัฒนาบทของอนิเมชั่น The Case Of Hana & Alice ฮานะ & อลิซ ปริศนาโรงเรียนหลอน นานถึง 10 ปี โดยนอกจากผู้กำกับ ชุนจิ อิวาอิ จะรับทั้งหน้าที่เขียนบท แต่งเพลง สเก็ตภาพด้วยตัวเอง เขายังได้ร่วมมือกับ "ซาโตโกะ โมริคาว่า" อนิเมเตอร์ผู้โด่งดังจากการออกแบบคาแร็คเตอร์ The Cat Returns (เดอะ แคท รีเทิร์น) อนิเมชั่นเรื่องดังจากสตูดิโอจิบลิ โดย โมริคาว่า ดัดแปลงจากรูปโฉมของ ยู อาโออิ และแอนน์ ซูซูกิ รวมถึงนักแสดงคนอื่นๆ ด้วย  รวมถึงการดึงเอาบรรยากกาศต่างที่ อิวาอิ วาดเอาไว้ในสตอรี่บอร์ด มาพัฒนาเป็น คาแร็คเตอร์ของภาพยนตร์เรื่องนี้

โดยหนังถ่ายทำโดยเทคนิค โรโตสโคป โดยการเคลื่อนไหวของงตัวละคร จะถูกทำด้วยมือทีละเฟรมโดยนักแอนิเมตอร์ ซึ่งจะเป็นการเคลื่อนไหว ที่อิงตามฟุตเตจที่ถ่ายทำมาด้วยคนแสดง จึงเป็นการเคลื่อนไหวทีสมจริงตามแบบการเคลื่อนไหวของคนแสดงจริงๆดูมีชีวิตชีวา ทั้งท่าทางและสีหน้า โดยหนังยล็อคบัสเตอร์ของฮอลลีวู้ด The Guardian pf Galaxy (การ์เดี้ยน ออฟ กาแร็คซี่) ก็เคยใช้เทคนิคนี้มาแล้ว เตรียมพิสูจน์ฝีมือกันได้ ใน "The Case Of Hana & Alice ฮานะ & อลิซ ปริศนาโรงเรียนหลอน" 17 กันยายนนี้ เฉพาะที่ ลิโด้ เฮ้าส์ อาร์ ซีเอและ ควอเทียร์ - ซีเนอาร์ต